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Una de las porciones más difíciles de estudiar para el gastroenterólogo es el intestino delgado, considerado durante décadas la parte ciega del tubo digestiva, ya que no existían métodos diagnósticos que pudieran visualizar la totalidad del intestino delgado. Se han diseñado endoscopios más largos y delgados con la posibilidad de estudiar estos sitios en pacientes con sangrado de origen oscuro (donde no se ha encontrado en los estudios habituales el sitio preciso de la hemorragia), pero en la actualidad se sigue investigando en mejorar estos equipos y actualmente se cuenta con un enteroscopio de doble balón que permite con mayor facilidad el estudio de todo el intestino delgado.

Actualmente existen centros hospitalarios del sector salud como son el CMN Siglo XXI y el Instituto Nacional de la Nutrición en donde se puede realizar este procedimiento y México es considerado como uno de los pioneros de la enteroscopia en Latinoamérica.